果胶酶是用于果汁澄清的一种酶制剂。
果胶酶作用于果胶中D-半乳糖醛酸残基之间的糖苷键，可以打破果胶分子，降解果胶的多糖链，生成寡聚半乳糖醛酸和少量半乳糖醛酸小分子物质，从而降低粘度，提高超滤速度，提高榨汁性能，减少榨汁时间，增强果香味，降低成本，提高果汁出汁率，减少二次沉淀，提高产品品质。
果蔬汁的压榨、澄清工艺中，添加量005-03L/t果蔬浆（酶活力以3万单位计）、pH35-40、温度45-55℃，作用1-5小时。可以起到澄清汁液、提高收率的作用。
葡萄酒加工中，果胶酶可以按照目的在浸渍、发酵或储存阶段添加，起到改善酒的色泽、增加酒香和提高出汁率的作用。推荐添加量005-02L/t果浆（酶活力以3万单位计）。可直接加到物料中也可以用少量原汁稀释后加到物料中。
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