根据防治需要，应用流行病学、病原与媒介生物学、病理学、免疫学、分子生物学、生物化学、药学及药理学等多学科研究手段和现代技术，开展疟疾、血吸虫病、丝虫病、包虫病、黑热病、食源性和土源性等重要寄生虫病的流行特点、传播规律、防治策略、控制与监测、免疫诊断技术、基因工程疫苗、防治药物等应用研究以及寄生虫与媒介的遗传变异、种群分化、宿主免疫、药物作用机制等寄生虫学基础研究。 目前在研的重大研究项目保持在20余项，均为国家与部级重点或国际合作项目，其中血吸虫病、疟疾约占70%；应用研究占80%以上。 历年来获奖成果70余项。其中包括中国大陆日本血吸虫品系的研究、日本血吸虫尾蚴钻穿宿主皮肤的研究、血吸虫病治疗药物、蒿甲醚预防日本、曼氏和埃及血吸虫病的应用及基础研究、血吸虫病免疫诊断技术、大山区血吸虫病流行因素、规律和干预措施研究、控制和阻断大山区血吸虫病流行对策研究、生态环境变化对血吸虫病流行态势的影响及干预措施研究、抗疟药磷酸咯萘啶、我国抗氯喹恶性疟的地理分布及其抗性程度与变化、海南省及其重点开发区疟疾流行潜势的调查研究、当前我国嗜人按蚊和中华按蚊传疟作用的比较研究、中华按蚊为媒介地区疟疾防治后期流行病学新特点和监测方案研究、嗜人按蚊地区疟疾流行潜势及控制暴发流行的研究、丝虫病防治后期低密度微丝蚴血症的传播作用的研究、中国阻断淋巴丝虫病传播的策略和技术措施的研究、陇南川西北阻断犬内脏利什曼病传播的研究、新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病的研究以及首次全国人体寄生虫分布调查等。以上成果的推广应用，在指导全国寄生虫病防治实践中发挥了重要作用，其中14项获得国家级科技成果奖励，2项获得“杜邦科技创新奖”。
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