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这篇12分文章介绍的、国人研发的数据库,你值得拥有!

网友发布 2022-10-26 21:10 · 头闻号数据库

本文转载自“科研小助手(微信号:SciRes)

相比于国外开发的数据库,我更喜欢国内开发的数据库,主要是两个原因:一个语言通俗易懂,表达方式非常适合中国人的理解;第二,简洁易打开,国外是数据库虽然很强大,但是页面都打不开,更不用提后续的应用了。今天给大家介绍的这个数据库,就是有温州医科大学的团队领衔开发的,主要汇集了cfDNA在27种疾病中的3种表观遗传修饰(5mc、5hmc和NP)。

CFEA

http://www.

bio-data.cn/CFEA/index.

jsp

网站在主页面上提供了三种修饰分别的检索入口,研究者可以通过自己的需求选择相应的入口。

条件选择好之后,点击search就可以看到相应的结果。筛选结果提供了cfDNA的基本信息,包括年龄、性别、疾病、用药、数据来源的文献及在UCSC上的匹配图。选取感兴趣的条目进行勾选,然后点击Download按钮就可以下载对应的bw文件,进行分析。

也可以直接发送到UCSC进行初步查看。

这个网站通过收录cfDNA三种修饰的信息,给研究者提供了方便的检索方式,同时通过均一化处理是来自不同测算方法的数据能够进行批量化对比,对发现新的突破点或者临床应用提供帮助。做cfDNA的小伙伴,快去试试。

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