东南大学四牌楼校区位于南京市玄武区四牌楼2号,九龙湖校区位于南京市江宁区东南大学路2号,丁家桥校区位于南京市鼓楼区湖南路丁家桥87号,苏州校区位于苏州市苏州工业园区林泉街399号,无锡分校位于无锡市新吴区菱湖大道99号。
东南大学创建于1902年的三江师范学堂。1921年以南京高等师范学校为基础建立国立东南大学,下设工科,其后工科又经历国立第四中山大学工学院、国立中央大学工学院、国立南京大学工学院等历史时期。

1952年全国院系调整,以原南京大学工学院为主体,并入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等学校的有关系科,在中央大学本部原址建立南京工学院;1988年5月,学校复更名为东南大学;2000年4月,原东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并,南京地质学校并入,组建新的东南大学。
东南大学有4个校区,分别是四牌楼校区、丁家桥校区、九龙湖校区、无锡分校。
1.四牌楼

校区地址:南京的中心玄武区四牌楼2号。该校区为研究生教育、本科生高年级教育、继续教育(除医学学科外)和科学技术研究基地。
2.丁家桥
校区地址:鼓楼区丁家桥。该校区为医学学科教育科研基地和东南大学附属中大医院所在地。

3.九龙湖
校区地址:江宁经济技术开发区南部。九龙湖校区建筑规划以东南大学的历史文脉为依据,采取公共核心教学组团与专业教学族群组团相结合的校园建筑形态九龙湖校区已建有教学区、科研实验区、行政区、本科生生活区、研究生生活区、教师生活区、后勤保卫区等。
4.无锡分校
校区地址:无锡太湖国际科技园区内。以培养电子信息领域内的高层次人才为目标。
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