应该是你的RNA已经降解了,而且可能不是跑胶过程中降解的。
另外,5分钟是不是有点时间太短了,可能都还没有跑开,你可以将电压调到120V 跑10~15min试试。如果RNA无降解的话,应该在2000和1000左右有两条带,100bp一下有一条较淡带或没有带。
祝顺利!
琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事?
从你的描述和图能看出几个问题
1.75V电压,300mA的电流,这电流是不是有点太大了?可能需要更换一下电泳液。
2.你说是提的基因组DNA,这个基因组DNA是多少bp的?1%的胶一般对应的500bp-1000bp左右的目标基因。你这个条带稍微跑出来一点,有可能是目的基因太大,目标基因的大小好歹也得在选用marker的范围之内。
3.胶配的倒是挺好的,不过你左右两条marker跑的速度怎么不一样快?是不一样的marker么?要是一样的,那我收回胶配的挺好的这句话。
4.我看有的条带很弥散,我觉得可能是电流大导致的发热大,最终是目标条带不见了。
根据我多年的经验,少年,你的胶背景亮说明你的UV开得太亮了,正常时候不需要这么强光就能看到条带。
从你胶的样子可以看出,你跑胶的时间太长了,看样子你用的是SYBR green,这种染料在你电泳的时候是会向条带相反方向移动的,跑时间太长,造成你的胶这样下面一部分已经看不到marker和背景亮光了。而过长时间跑胶造成的温度升高(拿在手里热乎乎的软软的,听起来像便便。。。),使胶中的样品和染料很多都扩散出去了,造成你的maker和条带整个的不够亮。
从你marker的位置可可以看出你跑胶的时间很长,因为最大的条带的位置比较低了。
即使你的背景这么强,也可以看出在你样品孔的下方很近的地方有条带,我不知道你样品的大小和来源,但是可以给出以下几个可能原因:
你的loading buffer不正确,造成样品条带异常移动
最可能原因是你的样品中DNA就那么大。如果你是提取质粒的话,你做错某步,把细菌的核DNA提取出来了,所以才那么大。你做错的可能是裂解那步,裂解时间超过5分钟了或者你剧烈混合裂解液和细菌了,只有invert就可以了。
你上样量也要保证,测一下浓度,一般200ng的条带就非常亮了。
跑胶时候,电压一般80-120,可以低,也可以高到200,但是室温下推荐80-100。时长20-60分钟为宜,一般推荐30分钟,不过你可以跑一段时间拿出来UV照一下,这时候你可以看到条带,如果分得不够开,再放回去跑一会就好了。如果实在需要长时间跑,放4度跑。
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